More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7622 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7622  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  62.9 
 
 
436 aa  523  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1691  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.85 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  decreased coverage  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1693  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.4 
 
 
427 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08740  nucleotide sugar dehydrogenase  60.63 
 
 
433 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160472  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.18 
 
 
433 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  58.14 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5916  nucleotide sugar dehydrogenase  50.45 
 
 
424 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.93 
 
 
447 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3014  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 
544 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5182  nucleotide sugar dehydrogenase  38.98 
 
 
503 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.42 
 
 
449 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.78 
 
 
445 aa  226  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
449 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  36.88 
 
 
462 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.88 
 
 
449 aa  217  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  36.07 
 
 
455 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  36.3 
 
 
460 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
424 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.38 
 
 
457 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  33.1 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.87 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  32.26 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  31.39 
 
 
431 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1457  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.69 
 
 
390 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0554439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 
433 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 
437 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.48 
 
 
432 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  30.53 
 
 
427 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  33.03 
 
 
437 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  33.94 
 
 
446 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  35.66 
 
 
416 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  32.65 
 
 
453 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.33 
 
 
408 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.67 
 
 
427 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 
435 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.17 
 
 
420 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.22 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.45 
 
 
435 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  33.78 
 
 
439 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  30.88 
 
 
407 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.89 
 
 
435 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.93 
 
 
424 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.77 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.84 
 
 
434 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  31.75 
 
 
432 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.09 
 
 
420 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.09 
 
 
420 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  35.37 
 
 
418 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.23 
 
 
427 aa  176  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.09 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  29.79 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 
441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.85 
 
 
439 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.42 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  36.42 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  30.45 
 
 
427 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.63 
 
 
438 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  33.93 
 
 
420 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0430  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.13 
 
 
416 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0727334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  29.98 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.87 
 
 
438 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  29.98 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  33.48 
 
 
448 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  29.98 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6019  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.53 
 
 
414 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892071  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  33.48 
 
 
448 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  34.63 
 
 
440 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  33.89 
 
 
451 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.11 
 
 
448 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1390  nucleotide sugar dehydrogenase  34.45 
 
 
420 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.51 
 
 
435 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.89 
 
 
413 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23380  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  31.1 
 
 
422 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377336  hitchhiker  0.00750781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  32.56 
 
 
453 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  32.8 
 
 
439 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.44 
 
 
438 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.73 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  33.79 
 
 
441 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.21 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.59 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4052  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.88 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.36 
 
 
450 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1195  nucleotide sugar dehydrogenase  35.67 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100781  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3999  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.57 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.762398  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2254  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.59 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  32.61 
 
 
461 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  28.93 
 
 
414 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.16 
 
 
413 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.4 
 
 
423 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0506  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.19 
 
 
412 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  29.61 
 
 
414 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.84 
 
 
438 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.54 
 
 
418 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4309  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.78 
 
 
420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.09 
 
 
419 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4147  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.78 
 
 
420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  33.11 
 
 
440 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>