91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2794 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  97.76 
 
 
223 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  92.83 
 
 
223 aa  423  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1534  hypothetical protein  87.91 
 
 
215 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1351  hypothetical protein  76.68 
 
 
214 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1390  hypothetical protein  76.68 
 
 
214 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1365  hypothetical protein  76.58 
 
 
214 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.159458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  76.58 
 
 
224 aa  357  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2995  hypothetical protein  75.34 
 
 
214 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  hitchhiker  0.00000185469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  60.37 
 
 
238 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3321  dienelactone hydrolase  56.4 
 
 
224 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206123  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3470  dienelactone hydrolase  57.41 
 
 
224 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00399877  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2983  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  56.67 
 
 
244 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2782  hypothetical protein  49.79 
 
 
236 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0438432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  56.59 
 
 
240 aa  235  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2428  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.781961  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  48.8 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  47.37 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  43.9 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  43.78 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  43.2 
 
 
214 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.59 
 
 
219 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  41.3 
 
 
262 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  41.79 
 
 
224 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  40.5 
 
 
330 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  41.38 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  40.51 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  40.51 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  43.81 
 
 
210 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  40.51 
 
 
231 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  39.6 
 
 
224 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  41.12 
 
 
207 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  37.98 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.77 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  43.52 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  39.9 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  38.12 
 
 
213 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  39.78 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  40.96 
 
 
212 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  34.68 
 
 
218 aa  121  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  37.89 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  36.92 
 
 
224 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  30.89 
 
 
200 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  33.33 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  34.18 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  33.97 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  33.49 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  33.49 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  31.98 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  33.17 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  32.12 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  38.62 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  32.02 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  33.16 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  33.14 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  34.15 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  33.16 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  27.38 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  33.33 
 
 
186 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  29.83 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0575  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  hitchhiker  0.00774359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0563  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0553  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.981391  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3442  hypothetical protein  27.39 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  30.12 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  29.86 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  26.01 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  30.67 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3074  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  31.72 
 
 
187 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  decreased coverage  0.0000000220174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10426  hypothetical protein  25.31 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.393398  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  31.01 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  35.11 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3866  dienelactone hydrolase  31.29 
 
 
186 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.708353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  31.61 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4023  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336562  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2624  alpha/beta hydrolase  21 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000020158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2865  hypothetical protein  26.13 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.57 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2672  hypothetical protein  26.13 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0230759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.05 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2593  alpha/beta hydrolase  21.43 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00594196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2870  hypothetical protein  20.55 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000300623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  39.71 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  29.13 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2896  hypothetical protein  21 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000115341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1918  alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 
233 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3288  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  31.33 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>