More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1865 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.53 
 
 
344 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  96.51 
 
 
344 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.24 
 
 
344 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.53 
 
 
344 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.53 
 
 
344 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  90.12 
 
 
344 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  98.84 
 
 
344 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
344 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.53 
 
 
344 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.42 
 
 
344 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  73.62 
 
 
345 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.93 
 
 
338 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.49 
 
 
336 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.18 
 
 
347 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.46 
 
 
334 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.94 
 
 
340 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.37 
 
 
340 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.26 
 
 
332 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.96 
 
 
338 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.18 
 
 
341 aa  417  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.76 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.73 
 
 
366 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.43 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.87 
 
 
331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.43 
 
 
366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.27 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.42 
 
 
333 aa  401  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.84 
 
 
334 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.84 
 
 
334 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.84 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.26 
 
 
334 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.28 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.28 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  58.54 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.98 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.57 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  58.54 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.98 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.54 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.98 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.59 
 
 
334 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.92 
 
 
317 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.23 
 
 
334 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.97 
 
 
333 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.18 
 
 
333 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
319 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
319 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.38 
 
 
317 aa  352  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.82 
 
 
331 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.29 
 
 
324 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.35 
 
 
313 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.53 
 
 
319 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.35 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.05 
 
 
331 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.6 
 
 
315 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.05 
 
 
331 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.4 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.98 
 
 
315 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.25 
 
 
328 aa  338  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
344 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.41 
 
 
313 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.16 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.21 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.43 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  60.46 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
331 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.12 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.41 
 
 
313 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  51.82 
 
 
337 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.7 
 
 
316 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.11 
 
 
313 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.05 
 
 
315 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.99 
 
 
334 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.77 
 
 
331 aa  331  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.89 
 
 
336 aa  331  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
337 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
335 aa  329  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.5 
 
 
337 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.89 
 
 
315 aa  328  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.21 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.7 
 
 
306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.36 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.41 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.22 
 
 
311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.63 
 
 
298 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
320 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>