39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1997 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  99.2 
 
 		 251 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  95.62 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  76.31 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  76.31 
 
 		 252 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  76.31 
 
 		 252 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  75.5 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  75.9 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  75.88 
 
 		 177 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  55.56 
 
 		 197 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  46.75 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  52.76 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  40.53 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  39.34 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  38.4 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  28.38 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  28.7 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.16 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  22.78 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  22.84 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  31.71 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.07 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.55 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  30.3 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  29.38 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  30.68 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  24.04 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  30.35 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  37.29 
 
 		 59 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  24.88 
 
 		 260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>