57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2900 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  62.35 
 
 		 672 aa  884    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  52.11 
 
 		 664 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  50.15 
 
 		 664 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  61.93 
 
 		 663 aa  853    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1377    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  40.84 
 
 		 656 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  39.95 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  38.18 
 
 		 276 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  31.13 
 
 		 386 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  39.77 
 
 		 286 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  35.82 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  27.78 
 
 		 638 aa  177  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  31.88 
 
 		 396 aa  160  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  30.45 
 
 		 627 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  35.43 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  35.39 
 
 		 278 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 		 264 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  27.69 
 
 		 417 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  30.31 
 
 		 428 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  30.31 
 
 		 428 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  31.78 
 
 		 431 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  30.99 
 
 		 438 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  30.63 
 
 		 438 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  28.81 
 
 		 451 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  28.74 
 
 		 451 aa  91.3  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  37.59 
 
 		 189 aa  91.3  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  29.29 
 
 		 451 aa  90.9  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  26.92 
 
 		 437 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  28.47 
 
 		 451 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  27.87 
 
 		 451 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  28.47 
 
 		 451 aa  87  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 425 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  27.87 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  27.87 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  34.83 
 
 		 425 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  30.7 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  27.87 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  29.39 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  34.83 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  34.16 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  34.16 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  33.66 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  34.33 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  34.33 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  31.22 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  26.86 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  33.66 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  30.77 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0663  hypothetical protein  23.35 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  30.58 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  26 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  25.46 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  25 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  22.41 
 
 		 319 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>