12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11003 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  39.86 
 
 
664 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  38.18 
 
 
663 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  39.86 
 
 
664 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  40.98 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  36.3 
 
 
663 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  35.71 
 
 
656 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  31.87 
 
 
672 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  31.09 
 
 
263 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  32.14 
 
 
278 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  28 
 
 
284 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>