56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3670 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1395    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  56.48 
 
 		 663 aa  791    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  62.35 
 
 		 663 aa  892    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  44.2 
 
 		 664 aa  595  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  44.44 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  39.73 
 
 		 656 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  41.94 
 
 		 380 aa  283  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  31.65 
 
 		 386 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  35.45 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  28.22 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  31.87 
 
 		 276 aa  170  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  31.01 
 
 		 627 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 396 aa  147  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  29.43 
 
 		 286 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  39.71 
 
 		 189 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  30.21 
 
 		 428 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  30.21 
 
 		 428 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  27.47 
 
 		 417 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  25.74 
 
 		 437 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  26.39 
 
 		 438 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  26.67 
 
 		 438 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  26.39 
 
 		 438 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  29.46 
 
 		 451 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  33.01 
 
 		 451 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  29.46 
 
 		 451 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  29.46 
 
 		 451 aa  88.6  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  29.46 
 
 		 451 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  29.05 
 
 		 451 aa  87  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  24.47 
 
 		 263 aa  87  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  31.6 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  32.37 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  29.05 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  29.05 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  29.05 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  29.05 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0663  hypothetical protein  23.97 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  30 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  28.48 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  28.37 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  31.71 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  31.58 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  31.71 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  32.27 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  32.58 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  32.27 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  31.02 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  31.02 
 
 		 430 aa  80.5  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  32.58 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  26.38 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  30.29 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  33.49 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  33.49 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  26.21 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  23.14 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  23.46 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>