56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0176 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  45.11 
 
 		 664 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  44.15 
 
 		 664 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  40.84 
 
 		 663 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  39.76 
 
 		 663 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  40.47 
 
 		 672 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  44.33 
 
 		 380 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  257  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  35.28 
 
 		 632 aa  210  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  29.07 
 
 		 638 aa  193  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  34.85 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  34.38 
 
 		 396 aa  175  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  30.81 
 
 		 627 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  27.98 
 
 		 417 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  28.89 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  28.89 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  31.29 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  34.73 
 
 		 450 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  44.76 
 
 		 189 aa  113  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  34.31 
 
 		 451 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  30.14 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  27.2 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  28.69 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  29.25 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  29.25 
 
 		 451 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  28.23 
 
 		 438 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  28.69 
 
 		 451 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  28.69 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  27.93 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  28.69 
 
 		 451 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  30.46 
 
 		 420 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  29.49 
 
 		 451 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  28.23 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  27.06 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  30.32 
 
 		 451 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  28.53 
 
 		 425 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  28.22 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  27.68 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  28.31 
 
 		 425 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  28.31 
 
 		 425 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  29.1 
 
 		 425 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  28.66 
 
 		 431 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  27.15 
 
 		 430 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  28.66 
 
 		 431 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  26.82 
 
 		 430 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  29.93 
 
 		 442 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  29.93 
 
 		 442 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  27.92 
 
 		 263 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  26.01 
 
 		 278 aa  95.1  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  29.07 
 
 		 428 aa  90.9  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  27.36 
 
 		 429 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0663  hypothetical protein  25.72 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  22.66 
 
 		 284 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  28.51 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  25.75 
 
 		 264 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>