49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0650 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  78.71 
 
 		 451 aa  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  78.49 
 
 		 451 aa  740    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  78.27 
 
 		 451 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  78.49 
 
 		 451 aa  741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  78.71 
 
 		 451 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  78.71 
 
 		 451 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  73.39 
 
 		 451 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  77.38 
 
 		 451 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  80.8 
 
 		 450 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  78.27 
 
 		 451 aa  739    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  925    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  78.05 
 
 		 451 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  43.57 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  43.1 
 
 		 425 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  43.78 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  42.14 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  43.1 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  42.14 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  42.14 
 
 		 442 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  41.9 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  41.9 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  40.94 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  39.67 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  39.44 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  41.76 
 
 		 343 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  30.98 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  33.01 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  32.08 
 
 		 438 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  31.85 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  32.84 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  28.97 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  28.97 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  32.26 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.51 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  31.29 
 
 		 656 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  27.75 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  29.11 
 
 		 638 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  26.87 
 
 		 632 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  30.03 
 
 		 396 aa  93.2  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  33.01 
 
 		 672 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  29.33 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  30.77 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  31.08 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  26.53 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  28.97 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  26.41 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  33.95 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>