49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3536 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  78.4 
 
 
451 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  78.27 
 
 
451 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  78.27 
 
 
451 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  78.27 
 
 
451 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  78.4 
 
 
451 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  78.17 
 
 
451 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  72.61 
 
 
451 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  77.73 
 
 
451 aa  736    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  926    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  77.95 
 
 
451 aa  740    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  80.8 
 
 
451 aa  755    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  77.95 
 
 
451 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  42.86 
 
 
425 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  42.11 
 
 
429 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  42.62 
 
 
431 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  42.62 
 
 
431 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  41.43 
 
 
431 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  42.14 
 
 
425 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  41.43 
 
 
425 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  42.38 
 
 
442 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  41.9 
 
 
425 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  42.38 
 
 
442 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  41.9 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  38.82 
 
 
428 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  39.76 
 
 
430 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  39.52 
 
 
430 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  40.66 
 
 
343 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  32.31 
 
 
438 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  32 
 
 
438 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  33.84 
 
 
437 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  31.76 
 
 
438 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  33.33 
 
 
417 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  29.95 
 
 
428 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  29.95 
 
 
428 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  30.77 
 
 
420 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  30.21 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  34.73 
 
 
656 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  32.06 
 
 
380 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  29.55 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  28.67 
 
 
638 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  29.53 
 
 
632 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  29.33 
 
 
663 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  31.22 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  30.32 
 
 
386 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  31.58 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  27.16 
 
 
664 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  34.97 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  27.64 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  25.26 
 
 
627 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>