49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3769 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  94.9 
 
 
451 aa  888    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  100 
 
 
451 aa  931    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  99.56 
 
 
451 aa  928    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  99.56 
 
 
451 aa  928    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  95.34 
 
 
451 aa  893    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  98.89 
 
 
451 aa  922    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  76.05 
 
 
451 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  94.01 
 
 
451 aa  880    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  78.27 
 
 
450 aa  738    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  94.01 
 
 
451 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  78.49 
 
 
451 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  94.24 
 
 
451 aa  886    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  43.4 
 
 
425 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  42.22 
 
 
431 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  42.45 
 
 
425 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  42.79 
 
 
425 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  42.49 
 
 
425 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  42.49 
 
 
425 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  41.9 
 
 
431 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  42.02 
 
 
429 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  41.9 
 
 
431 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  42.22 
 
 
442 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  42.22 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  39.63 
 
 
428 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  39.04 
 
 
430 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  38.8 
 
 
430 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  40.88 
 
 
343 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  34.1 
 
 
437 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  32.41 
 
 
438 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  32.99 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  31.6 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  30.66 
 
 
438 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  31.84 
 
 
417 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  29.14 
 
 
428 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  29.78 
 
 
428 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.79 
 
 
417 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  28.69 
 
 
656 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  27.78 
 
 
380 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  27.53 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  25.99 
 
 
638 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  27.87 
 
 
663 aa  87  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  29.05 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  27.89 
 
 
632 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  26.14 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  30.7 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  35.19 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  25.83 
 
 
664 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  28.84 
 
 
664 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  25.68 
 
 
627 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>