49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  84.69 
 
 
431 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  84.92 
 
 
431 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  81.09 
 
 
442 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  81.21 
 
 
429 aa  721    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  81.56 
 
 
425 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  83.45 
 
 
425 aa  741    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  892    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  81.09 
 
 
442 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  84.16 
 
 
425 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  83.22 
 
 
425 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  81.56 
 
 
425 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  52.26 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  47.97 
 
 
430 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  47.97 
 
 
430 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  43.03 
 
 
451 aa  359  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  42.14 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  41.98 
 
 
451 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  42.22 
 
 
451 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  41.51 
 
 
451 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  42.22 
 
 
451 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  51.04 
 
 
343 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  42.22 
 
 
451 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  41.98 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  41.51 
 
 
451 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  41.27 
 
 
451 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  41.27 
 
 
451 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  41.43 
 
 
450 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  36.98 
 
 
437 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  35.92 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  34.77 
 
 
438 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  34.53 
 
 
438 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  34.53 
 
 
438 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  30.79 
 
 
428 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  30.55 
 
 
428 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.23 
 
 
417 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  30.35 
 
 
420 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  27.2 
 
 
656 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  32.51 
 
 
380 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  30.52 
 
 
664 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  28.41 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  31.78 
 
 
663 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  32.12 
 
 
663 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  24.36 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  28.71 
 
 
664 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  31.6 
 
 
672 aa  86.3  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  29.62 
 
 
638 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  26.38 
 
 
632 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  24.75 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  32.3 
 
 
189 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>