49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0542 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  94.9 
 
 		 451 aa  888    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  94.9 
 
 		 451 aa  889    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  95.12 
 
 		 451 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  95.79 
 
 		 451 aa  900    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  95.34 
 
 		 451 aa  892    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  76.5 
 
 		 451 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  97.12 
 
 		 451 aa  907    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  78.4 
 
 		 450 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  96.67 
 
 		 451 aa  902    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  78.71 
 
 		 451 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  96.9 
 
 		 451 aa  903    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  42.45 
 
 		 425 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  42.55 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  41.98 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  42.49 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  41.51 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  42.45 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  42.22 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  41.98 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  41.98 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  40.09 
 
 		 428 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  39.76 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  39.52 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  41.18 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  34.09 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  29.93 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  29.93 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  32.41 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  32.53 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  31.57 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  32.59 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  32.74 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.79 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  30.14 
 
 		 656 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  28.06 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  26.98 
 
 		 638 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  29.29 
 
 		 663 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  26.8 
 
 		 663 aa  90.1  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  29.46 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  31.16 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  26.57 
 
 		 632 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  35.19 
 
 		 189 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  27.39 
 
 		 664 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  29.3 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  25.91 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>