49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0540 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  96.9 
 
 		 451 aa  903    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  94.24 
 
 		 451 aa  886    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  94.01 
 
 		 451 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  94.24 
 
 		 451 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  95.12 
 
 		 451 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  94.46 
 
 		 451 aa  887    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  75.17 
 
 		 451 aa  710    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  98.23 
 
 		 451 aa  913    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  77.95 
 
 		 450 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  99.78 
 
 		 451 aa  927    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  78.05 
 
 		 451 aa  738    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  42.69 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  41.27 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  42.55 
 
 		 425 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  42.49 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  41.98 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  42.25 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  41.9 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  42.22 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  42.22 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  41.98 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  39.63 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  39.28 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  39.28 
 
 		 430 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  40.88 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  34.09 
 
 		 437 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  30.23 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  30.23 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  31.72 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  31.81 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  30.6 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  32.34 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  32.41 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.54 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  29.25 
 
 		 656 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  28.43 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  26.73 
 
 		 638 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  29 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  29.46 
 
 		 672 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  27.69 
 
 		 663 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  28.47 
 
 		 663 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  31.34 
 
 		 632 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  30.7 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  24.8 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  24.87 
 
 		 664 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  34.57 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  26.25 
 
 		 627 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>