50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10998 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  790    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  35.71 
 
 
656 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  36.07 
 
 
380 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  39.47 
 
 
664 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  36.42 
 
 
664 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  34.48 
 
 
663 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  31.65 
 
 
672 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  31.13 
 
 
663 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  31.12 
 
 
632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  29.79 
 
 
638 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  26.63 
 
 
627 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  28.19 
 
 
396 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  41.04 
 
 
189 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  24.26 
 
 
438 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  24.53 
 
 
438 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  24.53 
 
 
438 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  26.69 
 
 
437 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  26.02 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  29.24 
 
 
430 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  29.24 
 
 
430 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  26.02 
 
 
428 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  25.68 
 
 
428 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  34.73 
 
 
417 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  31.63 
 
 
451 aa  90.9  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  31.63 
 
 
451 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  24.36 
 
 
431 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  31.16 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  29 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  28.98 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  28.98 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  30.32 
 
 
450 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  28.28 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  26.94 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  28.28 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  30.7 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  26.94 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  31.08 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  27.82 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  28.57 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  27.08 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  25.89 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  27.65 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0663  hypothetical protein  23.11 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>