49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02418 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  846    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  76.41 
 
 
417 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  34.52 
 
 
428 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  34.52 
 
 
428 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  34.89 
 
 
417 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  31.47 
 
 
430 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  31.24 
 
 
430 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  35.47 
 
 
438 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  35.22 
 
 
438 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  35.22 
 
 
438 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  32.26 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  32.99 
 
 
451 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  32.99 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  32.99 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  32.74 
 
 
451 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  31.82 
 
 
451 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  32.74 
 
 
451 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  32.48 
 
 
451 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  32.41 
 
 
451 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  32.41 
 
 
451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  30.77 
 
 
450 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  31.34 
 
 
425 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  32.15 
 
 
451 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  30.22 
 
 
425 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  30.17 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  33.75 
 
 
437 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  30.62 
 
 
425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  29.33 
 
 
431 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  30.22 
 
 
425 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  29.33 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  30.35 
 
 
431 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  30.22 
 
 
425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  30.14 
 
 
442 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  30.14 
 
 
442 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  31.91 
 
 
428 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  32.84 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  30.46 
 
 
656 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  25.53 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  28.48 
 
 
672 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  28.1 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  28.79 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  24.42 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  30.48 
 
 
663 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  27.65 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  26.73 
 
 
632 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  25.79 
 
 
627 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  30.27 
 
 
638 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  25.46 
 
 
663 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  32.12 
 
 
189 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>