49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1104 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  85.38 
 
 		 431 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  85.61 
 
 		 431 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  96.94 
 
 		 442 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  96.94 
 
 		 442 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  84.47 
 
 		 429 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  96.94 
 
 		 425 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  81.56 
 
 		 431 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  88.47 
 
 		 425 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  90.35 
 
 		 425 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  88.71 
 
 		 425 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  53.68 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  47.13 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  47.13 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  52.71 
 
 		 343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  42.45 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  42.25 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  42.45 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  42.49 
 
 		 451 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  42.25 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  41.9 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  41.9 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  40.24 
 
 		 451 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  36.5 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  35.96 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  33.33 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  33.09 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  33.09 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  31.05 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  31.16 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  31.16 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  30.22 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  36.32 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 656 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  29.02 
 
 		 664 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  27.04 
 
 		 664 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  34.95 
 
 		 632 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  32.64 
 
 		 663 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  29.25 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  33.66 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  26.94 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  27.59 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  25.4 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  32.92 
 
 		 189 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>