51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2748 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  97.14 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  96.73 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  83.86 
 
 		 221 aa  360  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  55.6 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  55.41 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  54.43 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  38.29 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  39.64 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  36.53 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  37.24 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  31.4 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  33.33 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  31.36 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.05 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  32.9 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.63 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.37 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.07 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  28.7 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  30.46 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.61 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  33.87 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  26.7 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  31.82 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  21.89 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  27.68 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.68 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.06 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.06 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.79 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  28.83 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  27.44 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  23.53 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  25.22 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.08 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.67 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  23.02 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  26.32 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  30.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.13 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  36.07 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  22.54 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  20.45 
 
 		 202 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  43.1 
 
 		 200 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.78 
 
 		 193 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.63 
 
 		 210 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>