More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  82.16 
 
 		 426 aa  717    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  79.16 
 
 		 427 aa  694    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 426 aa  846    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  59.49 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  46.94 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  45.54 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  45.62 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  44.3 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.33 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.62 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.85 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.97 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  45.96 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  45.7 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  44.59 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.56 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 446 aa  358  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.87 
 
 		 447 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  44.09 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  44.17 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  44.88 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  44.52 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  44.59 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.56 
 
 		 428 aa  355  8.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 		 438 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.91 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  44.04 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  43.84 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 441 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 441 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45 
 
 		 442 aa  348  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 441 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.19 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  43.68 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.85 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  44.44 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.28 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.98 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 435 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.1 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  42.82 
 
 		 432 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  43.59 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  44.21 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.73 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  44.04 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 		 446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.63 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 446 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.08 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.58 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  42.33 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  42.04 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.29 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.29 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  45.05 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  41.97 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  43.2 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  44.18 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.22 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  45.71 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  42.33 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  44.05 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 		 446 aa  325  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  43.84 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  43.84 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>