108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19840  Sec-independent protein secretion pathway component  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.87482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11750  Sec-independent protein secretion pathway component  62.5 
 
 		 319 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2832  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  63.54 
 
 		 245 aa  89.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.24 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.4 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.74 
 
 		 126 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.4 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.21 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.65 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  48.21 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  48.89 
 
 		 60 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 104 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  31.19 
 
 		 96 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 		 88 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 		 91 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  31.76 
 
 		 88 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 122 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.15 
 
 		 92 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.55 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.55 
 
 		 139 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  47.62 
 
 		 87 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 		 88 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.55 
 
 		 139 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  32.1 
 
 		 95 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 		 90 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.3 
 
 		 116 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  40.43 
 
 		 436 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  45 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.53 
 
 		 90 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  37.29 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.93 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 		 64 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 		 91 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  26.03 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 		 91 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  25.85 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  35.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.05 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  36.36 
 
 		 132 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.85 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  48.84 
 
 		 84 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  28.39 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  28.39 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  28.39 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  28.39 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.36 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  34.55 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  24.65 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  31.51 
 
 		 137 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  36.84 
 
 		 162 aa  45.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  47.5 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  26.92 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  40.74 
 
 		 133 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  47.5 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  43.75 
 
 		 96 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  32.32 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 		 77 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  29.73 
 
 		 76 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 66 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  27.74 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  34.55 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 58 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  38.64 
 
 		 57 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  43.75 
 
 		 95 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  26.23 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 58 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  32.79 
 
 		 71 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  32.79 
 
 		 71 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  31.15 
 
 		 91 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 		 55 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 		 99 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.08 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  35.56 
 
 		 57 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.8 
 
 		 94 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 		 59 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>