More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.29 
 
 
816 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  43.78 
 
 
797 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.78 
 
 
797 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  42.4 
 
 
813 aa  646    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.2 
 
 
838 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  45.47 
 
 
836 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.34 
 
 
816 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.21 
 
 
801 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  44.6 
 
 
817 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  44.07 
 
 
832 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  44.71 
 
 
836 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  43.95 
 
 
802 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.11 
 
 
828 aa  680    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  43.02 
 
 
837 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  44.86 
 
 
816 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  43.82 
 
 
802 aa  664    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  43.95 
 
 
802 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  44.07 
 
 
802 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.26 
 
 
843 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  44.6 
 
 
816 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.62 
 
 
823 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  45.25 
 
 
801 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.43 
 
 
848 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.2 
 
 
802 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.91 
 
 
808 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  43.91 
 
 
797 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.04 
 
 
831 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.09 
 
 
801 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.87 
 
 
815 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.12 
 
 
815 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.67 
 
 
816 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  43.21 
 
 
801 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.56 
 
 
839 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  43.78 
 
 
797 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.86 
 
 
838 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.96 
 
 
859 aa  636    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.6 
 
 
816 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  43.28 
 
 
835 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.55 
 
 
823 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.24 
 
 
828 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  43.82 
 
 
802 aa  664    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.49 
 
 
818 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.68 
 
 
844 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.98 
 
 
826 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  43.78 
 
 
797 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.39 
 
 
842 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.16 
 
 
841 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.23 
 
 
821 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.05 
 
 
836 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.1 
 
 
807 aa  647    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.78 
 
 
797 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.42 
 
 
840 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1989  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.72 
 
 
848 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  40.89 
 
 
876 aa  644    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.42 
 
 
838 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.94 
 
 
846 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.94 
 
 
846 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  42.87 
 
 
817 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.05 
 
 
838 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.94 
 
 
831 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  43.37 
 
 
815 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.62 
 
 
801 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1359  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.26 
 
 
843 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43 
 
 
817 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.73 
 
 
831 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2646  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.58 
 
 
787 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  43.02 
 
 
811 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2332  phosphorylase 2  44.46 
 
 
787 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
819 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.08 
 
 
842 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.25 
 
 
801 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.26 
 
 
837 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.14 
 
 
837 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.46 
 
 
802 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  42.54 
 
 
812 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  40.81 
 
 
800 aa  636    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  42.3 
 
 
812 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.77 
 
 
827 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.59 
 
 
834 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.56 
 
 
832 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.82 
 
 
838 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  41.27 
 
 
829 aa  663    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.67 
 
 
870 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.26 
 
 
837 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.87 
 
 
817 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2028  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.42 
 
 
844 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550942  normal  0.926011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.51 
 
 
829 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.37 
 
 
815 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  42.63 
 
 
815 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.6 
 
 
816 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.26 
 
 
843 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  41.83 
 
 
834 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.55 
 
 
840 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  43.37 
 
 
815 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>