More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0727 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.7 
 
 
859 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.731107  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4976  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  760    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.7 
 
 
832 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00073927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.96 
 
 
816 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  45.25 
 
 
836 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.08 
 
 
816 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  47.74 
 
 
817 aa  721    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.41 
 
 
822 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5005  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  763    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  763    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.98 
 
 
821 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  760    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.51 
 
 
828 aa  732    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  41.95 
 
 
816 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02552  putative maltodextrin phosphorylase  42.84 
 
 
837 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0284872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0554  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.68 
 
 
820 aa  797    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.97 
 
 
815 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.59 
 
 
848 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0228  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.11 
 
 
831 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.27 
 
 
831 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.75 
 
 
808 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.16 
 
 
816 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.42 
 
 
817 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.25 
 
 
828 aa  759    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.96 
 
 
816 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.94 
 
 
802 aa  763    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0176  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.22 
 
 
828 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23902  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.42 
 
 
838 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.46 
 
 
835 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  42.54 
 
 
835 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2722  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.39 
 
 
843 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3735  glycogen phosphorylase  45.62 
 
 
815 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  760    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2246  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.53 
 
 
824 aa  678    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.71978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0913  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.23 
 
 
841 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0414  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.01 
 
 
793 aa  641    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0359  Phosphorylase  42.8 
 
 
824 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.262429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.43 
 
 
818 aa  664    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.16 
 
 
841 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  44.58 
 
 
815 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.15 
 
 
834 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.71 
 
 
842 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0789  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.6 
 
 
818 aa  728    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  42.84 
 
 
817 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.15 
 
 
838 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.41 
 
 
831 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3801  glycogen phosphorylase  45.62 
 
 
815 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3199  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.13 
 
 
811 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3904  glycogen phosphorylase  45.62 
 
 
815 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304876  normal  0.462379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.84 
 
 
831 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3843  glycogen phosphorylase  45.62 
 
 
815 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.400184  normal  0.614217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2646  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.94 
 
 
787 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  50.93 
 
 
811 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2332  phosphorylase 2  45.31 
 
 
787 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1983  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.46 
 
 
836 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000313415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.12 
 
 
850 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.16 
 
 
849 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0242  glycogen phosphorylase  49.75 
 
 
802 aa  764    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239984  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3933  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.72 
 
 
815 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0411  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.07 
 
 
827 aa  696    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.908979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0562  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.5 
 
 
804 aa  768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  100 
 
 
800 aa  1652    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1050  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.01 
 
 
809 aa  694    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4995  glycogen phosphorylase  49.87 
 
 
802 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.96 
 
 
817 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3391  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.39 
 
 
843 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0281  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.11 
 
 
815 aa  653    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3724  glycogen phosphorylase  45.62 
 
 
815 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03233  hypothetical protein  44.14 
 
 
815 aa  650    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.33 
 
 
816 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0227  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.11 
 
 
815 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0255274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4740  glycogen phosphorylase  44.02 
 
 
815 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  44.46 
 
 
815 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.06 
 
 
815 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.03 
 
 
841 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.58 
 
 
815 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  44.14 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.88 
 
 
815 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1992  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.59 
 
 
842 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000769709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  41.74 
 
 
816 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3649  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.03 
 
 
820 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5208  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.8 
 
 
848 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3758  glycogen phosphorylase  41.74 
 
 
822 aa  634  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.28 
 
 
846 aa  633  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.28 
 
 
846 aa  633  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2235  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.72 
 
 
842 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45650  glycogen phosphorylase  40.74 
 
 
815 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  40.95 
 
 
829 aa  633  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.95 
 
 
829 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.98 
 
 
807 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3347  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.15 
 
 
820 aa  632  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>