More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2332 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.5 
 
 		 817 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0913  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.86 
 
 		 841 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4995  glycogen phosphorylase  46.9 
 
 		 802 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.21 
 
 		 832 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00073927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5005  glycogen phosphorylase  46.22 
 
 		 802 aa  687    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  44.22 
 
 		 836 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.87 
 
 		 833 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0518107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.39 
 
 		 828 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  48.04 
 
 		 817 aa  714    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.7 
 
 		 817 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  43.42 
 
 		 836 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  46.22 
 
 		 802 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.76 
 
 		 828 aa  723    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  44.12 
 
 		 837 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3716  maltodextrin phosphorylase  43.41 
 
 		 797 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  46.34 
 
 		 802 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  46.22 
 
 		 802 aa  687    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  46.22 
 
 		 802 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3391  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.16 
 
 		 843 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0685  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.46 
 
 		 828 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0757795  hitchhiker  0.000741199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.92 
 
 		 842 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.32 
 
 		 802 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.75 
 
 		 848 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  44.21 
 
 		 837 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1359  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.66 
 
 		 843 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.65 
 
 		 815 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.25 
 
 		 818 aa  704    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.64 
 
 		 833 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3713  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5031  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.54 
 
 		 845 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  46.96 
 
 		 817 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.15 
 
 		 859 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02552  putative maltodextrin phosphorylase  46.05 
 
 		 837 aa  705    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0284872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.11 
 
 		 841 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.74 
 
 		 838 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.46 
 
 		 835 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.41 
 
 		 829 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.16 
 
 		 834 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.94 
 
 		 843 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.96757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.92 
 
 		 833 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  46.34 
 
 		 802 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0359  Phosphorylase  42.48 
 
 		 824 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.262429  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.2 
 
 		 844 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  46.58 
 
 		 817 aa  700    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2235  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.79 
 
 		 842 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.11 
 
 		 841 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.66 
 
 		 843 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.53 
 
 		 807 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.53 
 
 		 843 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2334  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.96 
 
 		 847 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  43.55 
 
 		 816 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.86 
 
 		 839 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.05 
 
 		 846 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.05 
 
 		 846 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  42.34 
 
 		 817 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.98 
 
 		 801 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  43.98 
 
 		 801 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3026  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.66 
 
 		 843 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.87 
 
 		 822 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0242  glycogen phosphorylase  47.03 
 
 		 802 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.4 
 
 		 801 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.42 
 
 		 831 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2646  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  98.73 
 
 		 787 aa  1580    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  47.52 
 
 		 811 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2332  phosphorylase 2  100 
 
 		 787 aa  1597    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3347  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.12 
 
 		 820 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.02 
 
 		 850 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.98 
 
 		 849 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.96 
 
 		 837 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.71 
 
 		 837 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.45 
 
 		 838 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.47 
 
 		 802 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  45.31 
 
 		 800 aa  685    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.72 
 
 		 821 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2246  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.7 
 
 		 824 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.71978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.08 
 
 		 832 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.86 
 
 		 838 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3884  maltodextrin phosphorylase  43.41 
 
 		 797 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0527  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.46 
 
 		 828 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.84 
 
 		 837 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3822  maltodextrin phosphorylase  43.29 
 
 		 797 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.562887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.9 
 
 		 833 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.05 
 
 		 829 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.58 
 
 		 837 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.59 
 
 		 836 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3788  maltodextrin phosphorylase  43.41 
 
 		 797 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4976  glycogen phosphorylase  46.34 
 
 		 802 aa  687    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4724  maltodextrin phosphorylase  43.16 
 
 		 797 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.33 
 
 		 834 aa  681    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0038  maltodextrin phosphorylase  46.62 
 
 		 817 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.68 
 
 		 842 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.2 
 
 		 859 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.731107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  43.34 
 
 		 815 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.15 
 
 		 808 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>