More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0558 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.29 
 
 
833 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0518107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.7 
 
 
815 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4995  glycogen phosphorylase  54.99 
 
 
802 aa  916    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  46.71 
 
 
813 aa  661    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.11 
 
 
837 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  46.02 
 
 
836 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3735  glycogen phosphorylase  44.69 
 
 
815 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.99 
 
 
802 aa  910    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  46.66 
 
 
817 aa  722    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  42.01 
 
 
832 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  43.24 
 
 
836 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  54.86 
 
 
802 aa  915    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  39.55 
 
 
821 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  43.61 
 
 
837 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
828 aa  1723    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  55.11 
 
 
802 aa  917    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  55.11 
 
 
802 aa  919    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  55.11 
 
 
802 aa  917    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.36 
 
 
841 aa  719    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.09 
 
 
827 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.31 
 
 
843 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.96757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.49 
 
 
848 aa  685    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.54 
 
 
839 aa  710    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0685  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.61 
 
 
828 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0757795  hitchhiker  0.000741199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  44.53 
 
 
837 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.75 
 
 
822 aa  701    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0038  maltodextrin phosphorylase  42.19 
 
 
817 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2334  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42 
 
 
847 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.76 
 
 
817 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  42.57 
 
 
817 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  55.36 
 
 
802 aa  925    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3843  glycogen phosphorylase  44.43 
 
 
815 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.400184  normal  0.614217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3724  glycogen phosphorylase  44.69 
 
 
815 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.48 
 
 
838 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.09 
 
 
835 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5005  glycogen phosphorylase  54.86 
 
 
802 aa  915    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.54 
 
 
842 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.3 
 
 
823 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.99 
 
 
833 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  55.11 
 
 
802 aa  917    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02552  putative maltodextrin phosphorylase  43.81 
 
 
837 aa  666    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.67 
 
 
844 aa  718    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.25 
 
 
826 aa  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1359  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
843 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  42.57 
 
 
815 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.74 
 
 
841 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2246  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.43 
 
 
824 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.71978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.87 
 
 
859 aa  689    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  42.45 
 
 
815 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.76 
 
 
834 aa  747    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2235  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.86 
 
 
842 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0242  glycogen phosphorylase  54.86 
 
 
802 aa  914    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239984  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.79 
 
 
846 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.79 
 
 
846 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  41.26 
 
 
817 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.28 
 
 
832 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00073927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.36 
 
 
842 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3904  glycogen phosphorylase  44.69 
 
 
815 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304876  normal  0.462379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.7 
 
 
829 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  43.91 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
843 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.97 
 
 
831 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2646  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.53 
 
 
787 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  52.88 
 
 
811 aa  861    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2332  phosphorylase 2  44.39 
 
 
787 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3391  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.38 
 
 
843 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.8 
 
 
850 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.37 
 
 
849 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.32 
 
 
837 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.32 
 
 
837 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.49 
 
 
843 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.95 
 
 
838 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4976  glycogen phosphorylase  55.11 
 
 
802 aa  917    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  48.25 
 
 
800 aa  781    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.42 
 
 
828 aa  706    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.13 
 
 
818 aa  695    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0527  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.61 
 
 
828 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.21 
 
 
832 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.71 
 
 
838 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  40.58 
 
 
829 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4740  glycogen phosphorylase  43.78 
 
 
815 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.44 
 
 
837 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3801  glycogen phosphorylase  44.69 
 
 
815 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.69 
 
 
833 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.7 
 
 
829 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  42.48 
 
 
817 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  40.91 
 
 
798 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3199  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.71 
 
 
811 aa  751    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3026  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
843 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.19 
 
 
836 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  40.82 
 
 
817 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5031  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.13 
 
 
845 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  40.52 
 
 
808 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>