More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  46.32 
 
 
641 aa  228  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 
627 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  41.56 
 
 
568 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  38.17 
 
 
269 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  38.74 
 
 
593 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
568 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  37.78 
 
 
282 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.06 
 
 
571 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  37.04 
 
 
574 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  42.52 
 
 
497 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  38.29 
 
 
605 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  41.78 
 
 
481 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  32.1 
 
 
576 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  40.47 
 
 
501 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
509 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  34.01 
 
 
581 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.56 
 
 
568 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.86 
 
 
226 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 
568 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.03 
 
 
281 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.76 
 
 
541 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  37 
 
 
478 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 
254 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  36.65 
 
 
273 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  36.65 
 
 
273 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  36.6 
 
 
288 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 
284 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  33.73 
 
 
288 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.07 
 
 
280 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  34.01 
 
 
557 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.84 
 
 
292 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.01 
 
 
278 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  35.82 
 
 
272 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.79 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  37.91 
 
 
647 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 
281 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
630 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.67 
 
 
398 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  36.6 
 
 
510 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  34.32 
 
 
280 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.89 
 
 
548 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  35.08 
 
 
380 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  36.2 
 
 
228 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.1 
 
 
310 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.21 
 
 
277 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
278 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.46 
 
 
280 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.77 
 
 
286 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  36.33 
 
 
574 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.08 
 
 
276 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.59 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  33.2 
 
 
564 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.39 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.33 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  37.79 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.4 
 
 
402 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0584  membrane associated ATPase  36.65 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 
440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.79 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.98 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  31.56 
 
 
284 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.63 
 
 
571 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  32.49 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  37.44 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1048  ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 
281 aa  145  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.32 
 
 
283 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.64 
 
 
261 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
453 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.86 
 
 
252 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  33.6 
 
 
283 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 
277 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  32.82 
 
 
569 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  33.59 
 
 
569 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.6 
 
 
243 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.28 
 
 
267 aa  144  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.59 
 
 
293 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.12 
 
 
403 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.39 
 
 
280 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 
579 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.39 
 
 
280 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1255  ABC transporter related  33.06 
 
 
250 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  35.22 
 
 
290 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 
569 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.59 
 
 
293 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  36.41 
 
 
227 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
395 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  30.38 
 
 
237 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
243 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
234 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 
270 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.98 
 
 
293 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.59 
 
 
293 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
770 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.98 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1963  ABC transporter, ATPase subunit  33.21 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>