60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3086 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  583  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  52.57 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  49.08 
 
 		 291 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  51.65 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  49.26 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  42.55 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  38.55 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  38.83 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  38.6 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  38.83 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  38.41 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  41.02 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  41.7 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  34.17 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  36.3 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  38.3 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  35.79 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  35.42 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  29.78 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  35.53 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  36.04 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  29.2 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  31.58 
 
 		 500 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.83 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  32.72 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  31.73 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.18 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.69 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  32.84 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  30.27 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  31.84 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 625 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  31.34 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.45 
 
 		 626 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 626 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  28.43 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 626 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  28.88 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  27.04 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  32.12 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  31.61 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  24.03 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  32.12 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  23.83 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  25.1 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  30.54 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  30.89 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  23.05 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  23.08 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  25.67 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  22.83 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  27.67 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>