More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1106 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
364 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
361 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
371 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
371 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
377 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.91 
 
 
346 aa  129  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.53 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
364 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.7 
 
 
371 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  29.66 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.73 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
406 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 
362 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
374 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
362 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
362 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
364 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
364 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
395 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  25.38 
 
 
362 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
377 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
385 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
536 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
394 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.95 
 
 
401 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
373 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
365 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
367 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  30.5 
 
 
391 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
426 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
384 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
412 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
436 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
403 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
385 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
387 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.11 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
413 aa  92.8  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
392 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
381 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1232  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.86 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
458 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
421 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  27.32 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.9 
 
 
822 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0474  phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  21.92 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 
363 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
379 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.63 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
423 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
438 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
416 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
373 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>