211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0442 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.5 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.5 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.5 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.5 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0488  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.63 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.81 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2131  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.87 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000114476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1544  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.53 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1616  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.53 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0880951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3767  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.53 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1685  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.53 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1246  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1578  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.53 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  32.35 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
642 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  32.8 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.78 
 
 
644 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.67 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  49.18 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  30.97 
 
 
179 aa  60.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.4 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  43.4 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  43.4 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.67 
 
 
525 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.4 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.4 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
513 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
510 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  43.4 
 
 
508 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.4 
 
 
508 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
508 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.71 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  41.51 
 
 
508 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.01 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  41.51 
 
 
508 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.67 
 
 
525 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.38 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  44.07 
 
 
63 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
181 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36.76 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
227 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
639 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
513 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
507 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  38.98 
 
 
206 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.59 
 
 
479 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
512 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.53 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  37.1 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  38.55 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.07 
 
 
643 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2958  Rieske (2Fe-2S) region  42.42 
 
 
223 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
513 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
508 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
531 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  52.17 
 
 
645 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  27.78 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
521 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.35 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.14 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
504 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  27.67 
 
 
217 aa  53.9  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
136 aa  53.9  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.25 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.62 
 
 
640 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  35.29 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.05 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
520 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.1 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.05 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.05 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.43 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05261  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.34 
 
 
178 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.100981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  25.22 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.22 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.22 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  25.22 
 
 
102 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  35.42 
 
 
521 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
499 aa  51.2  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
506 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  44.68 
 
 
216 aa  50.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  31.58 
 
 
131 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  25.95 
 
 
179 aa  50.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
526 aa  50.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.22 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  25.47 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>