65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2128 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  100 
 
 		 359 aa  751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  71.71 
 
 		 360 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  71.43 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  71.71 
 
 		 357 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  68.91 
 
 		 355 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  68.07 
 
 		 359 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  66.39 
 
 		 357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  66.39 
 
 		 357 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  66.11 
 
 		 357 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  66.39 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  66.67 
 
 		 363 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  66.39 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  59.56 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  50.86 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  51.88 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  51.01 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  48.03 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  50.29 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  46.86 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  46.5 
 
 		 356 aa  355  6.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  47.29 
 
 		 365 aa  346  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  46.57 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  44.6 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  25.21 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  23.84 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.75 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  22.53 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  26.11 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  22.71 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  23.31 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  21.95 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  24.18 
 
 		 339 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  21.47 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  21.31 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  22.7 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  22.69 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.97 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  23.08 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  29.47 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25.74 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  19.18 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  20.26 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  23.29 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  26.42 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  22.82 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  24.43 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  23.44 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  21.57 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  23.5 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.57 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  28.3 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.5 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  20.94 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  23.84 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  28.57 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.24 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  21.47 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>