27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4483 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  100 
 
 		 364 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  93.28 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  92.54 
 
 		 520 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  67.44 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  44.03 
 
 		 229 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  66.15 
 
 		 262 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  25.24 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  76.32 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  43.82 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  73.68 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  73.68 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  71.05 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  54.55 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  31.15 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  29.66 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  31.15 
 
 		 670 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  35.37 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  63.16 
 
 		 892 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  57.14 
 
 		 701 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  67.65 
 
 		 962 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  35.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  42.86 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  52.08 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  43.4 
 
 		 569 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  41.43 
 
 		 168 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  32.47 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  36.84 
 
 		 263 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>