57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0218 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  97.47 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  93.04 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  84.18 
 
 		 158 aa  280  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  51.66 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  48.1 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  53.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  47.47 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  46.84 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  46.84 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  48.15 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  46.91 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  45.83 
 
 		 162 aa  136  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  45.14 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  45.14 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  41.5 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  41.5 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  35.85 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  34.97 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  33.97 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  36 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  38.52 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  37.78 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  37.78 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  34.13 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  36.57 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  37.5 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  37.5 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  33.11 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  37.86 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  33.14 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  37.5 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  33.13 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  31.88 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  34.59 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  32.54 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  32.54 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  27.95 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  28.89 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  27.95 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  26.74 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  26.74 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  26.74 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  26.74 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  26.74 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  26.71 
 
 		 356 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  26.21 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  26.21 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  38.24 
 
 		 88 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  26.95 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>