154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3464 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  100 
 
 		 239 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  97.49 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.6 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  49.49 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0351  hypothetical protein  51.35 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.786084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  49.75 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0342  hypothetical protein  51.35 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.360607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0361  hypothetical protein  51.35 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0353  hypothetical protein  51.35 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0346  hypothetical protein  51.35 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  44.84 
 
 		 439 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  45.64 
 
 		 450 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4193  hypothetical protein  44.95 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.84 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  45.73 
 
 		 412 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  46.73 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  47.49 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  46.73 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  49.16 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4116  hypothetical protein  42.22 
 
 		 335 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  44.55 
 
 		 378 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  41.85 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  48.6 
 
 		 403 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  45.45 
 
 		 518 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  45.45 
 
 		 524 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  49.72 
 
 		 481 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  44.95 
 
 		 475 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  47.06 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  46.23 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.59 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  44.95 
 
 		 462 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  44.95 
 
 		 462 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 415 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.15 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  47.06 
 
 		 504 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.71 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  39.47 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  42.86 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  41.75 
 
 		 415 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 449 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.56 
 
 		 408 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  41.75 
 
 		 406 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  44.39 
 
 		 477 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  41.75 
 
 		 396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  45.25 
 
 		 494 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  44.44 
 
 		 355 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  45.81 
 
 		 485 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  43.39 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  48.11 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  44.69 
 
 		 487 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  44.13 
 
 		 478 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  42.36 
 
 		 445 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  39.61 
 
 		 492 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  41.26 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  44.13 
 
 		 545 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  42.25 
 
 		 502 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.16 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.76 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.22 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  42.21 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  29.57 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  29.57 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1254  hypothetical protein  30.72 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000299618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1307  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.46981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  32.88 
 
 		 171 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  36.67 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.53 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.34 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.09 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.74 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  34.07 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  34.07 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  29.76 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  26.85 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.67 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  29.32 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  29.32 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.69 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.37 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.91 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.32 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  28.67 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>