More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3038 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3038  heat shock protein DnaJ-like protein  100 
 
 
94 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.928847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2457  heat shock protein DnaJ domain protein  84.04 
 
 
94 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000320738  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1868  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  84.04 
 
 
94 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0272604  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1631  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  84.04 
 
 
94 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.261278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  84.04 
 
 
94 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0852729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1832  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  84.04 
 
 
94 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.244123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1850  DnaJ domain-containing protein  82.98 
 
 
94 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1539  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  82.98 
 
 
94 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1606  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  82.98 
 
 
94 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00300072  normal  0.339336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1600  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  82.98 
 
 
94 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.537341  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0750  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  82.8 
 
 
94 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1823  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  80.65 
 
 
94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00689544  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.28 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.28 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44959  predicted protein  47.76 
 
 
500 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00935633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
375 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  43.28 
 
 
377 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
380 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  41.3 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
378 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  41.79 
 
 
645 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
382 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
372 aa  62  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
368 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
377 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
379 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
396 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89287  predicted protein  40 
 
 
346 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0180509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
381 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
404 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
380 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
378 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
378 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
382 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  40.3 
 
 
380 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
380 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  42.03 
 
 
287 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
382 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
387 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
366 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.79 
 
 
330 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
375 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  45.59 
 
 
279 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
373 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
373 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
375 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
374 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
392 aa  58.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
385 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
386 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
377 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
382 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.28 
 
 
334 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
380 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  38.81 
 
 
381 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
380 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15224  predicted protein  44.93 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
385 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
385 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  37.33 
 
 
292 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>