48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0207 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 256 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  64.04 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  55.47 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  50.6 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  31.93 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  41.35 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  31.56 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  31.56 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  29.65 
 
 		 759 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  30.4 
 
 		 703 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  27.98 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  29.76 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  28.39 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  24.86 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  25.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  28.48 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  26.4 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  28.09 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  27.87 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.29 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  25.79 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  34.85 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  28.42 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.17 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  30.3 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>