More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1708 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  55.93 
 
 		 299 aa  338  8e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  51.33 
 
 		 296 aa  300  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  52.35 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  49.66 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  50.51 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  49.49 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  49.49 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  48.82 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1915  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.4 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0712701  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  33.9 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  24.6 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  25.12 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  25.12 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0247  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  24.64 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5198  DNA-binding response regulator  29.7 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.83 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4816  response regulator  29.7 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000589569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.81 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2806  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1222  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.79 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.117509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  31.9 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4954  DNA-binding response regulator  29.7 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5331  DNA-binding response regulator  29.7 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000933212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.39 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4093  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5248  DNA-binding response regulator  29.7 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.4 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  30.7 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  28.45 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3062  two-component response regulator CbrB  37.84 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  44.07 
 
 		 472 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0006  DNA-binding response regulator  28.48 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0125  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 477 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.261206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  30.47 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0088  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 459 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  24.82 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3625  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  33.33 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4796  response regulator  29.09 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000140673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0988  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.03 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  44.9 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.81 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  44.9 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  44.9 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.26 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  33.63 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  33.33 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.72 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  44.9 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3682  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.666768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4695  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  28.45 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.93 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  26.47 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0737  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000126889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  32.48 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0680  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.736075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4270  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>