More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1309 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  51.98 
 
 		 231 aa  235  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  47.16 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  50.87 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  47.41 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  41.74 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  44.02 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  39.57 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  39.57 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  32 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  29.38 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  26.42 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  29.77 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  28.14 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  24.88 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.77 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.63 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.06 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  24.53 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.33 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  26.86 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  24.48 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.75 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  27.75 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  29.07 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  26.98 
 
 		 251 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.75 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  28.44 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.84 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  30.65 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  28.37 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  24.58 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.61 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.2 
 
 		 330 aa  78.6  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.65 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  25.76 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  27.96 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.89 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  25.85 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  24.56 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.89 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.6 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  26.72 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  23.35 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.26 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  23.98 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  27.43 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25.22 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0272  O-methyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  23.25 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  39.81 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  40.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  40.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  40.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  40.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  40.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.47 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  22.52 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  35.64 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  25.53 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  41.49 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.1 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  25.32 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  24.68 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  23.04 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.65 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  22.58 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  22.64 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  23.71 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  24.89 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  35 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  34 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  31.64 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  36.84 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  30.2 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.23 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  25.1 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.69 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.69 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  25.93 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>