36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1239 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  48.97 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  47.5 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  44.59 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  50.64 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  52.78 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  45.22 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  53.78 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  43.85 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  41.94 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  46.48 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  41.71 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  51.77 
 
 		 210 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  38.73 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  45.45 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  45.45 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  45.45 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  44.81 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  42.5 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  38.59 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  37.93 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  31.61 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  34.27 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  37.1 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  29.12 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  34.2 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  32.43 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  34.95 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  28.21 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  32 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  29.06 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 		 124 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>