237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4341 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  100 
 
 
230 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  100 
 
 
230 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
230 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
230 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  89.07 
 
 
206 aa  347  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  84.78 
 
 
185 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  84.24 
 
 
185 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  85.08 
 
 
181 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  52.63 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  50 
 
 
228 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  49.13 
 
 
228 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  49.13 
 
 
228 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  48.7 
 
 
228 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  48.88 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  48.43 
 
 
238 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  47.98 
 
 
238 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  47.3 
 
 
341 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  47.3 
 
 
263 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  48.39 
 
 
212 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  43.48 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  42.92 
 
 
235 aa  191  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  42.06 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  41.2 
 
 
235 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  43.52 
 
 
215 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  42.54 
 
 
238 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  44.6 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  44.6 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.71 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  43.19 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  42.72 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  43.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  43.19 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  40.2 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  42.33 
 
 
254 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  42.33 
 
 
254 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  42.33 
 
 
264 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  41.23 
 
 
235 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  41.78 
 
 
235 aa  159  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  41.4 
 
 
255 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  42.16 
 
 
202 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  40 
 
 
250 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  40 
 
 
250 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  39.91 
 
 
235 aa  150  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  37.84 
 
 
226 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  37.84 
 
 
226 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  37.84 
 
 
226 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  38.83 
 
 
226 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  37.14 
 
 
250 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  37.62 
 
 
259 aa  148  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  37.14 
 
 
250 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.84 
 
 
226 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  37.68 
 
 
226 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  37.68 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  37.44 
 
 
346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  39.25 
 
 
214 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  37.38 
 
 
226 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  38.24 
 
 
226 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  38.28 
 
 
226 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  35.55 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  37.14 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  36.67 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  35.55 
 
 
237 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  37.14 
 
 
250 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.67 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  37.2 
 
 
226 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  36.02 
 
 
237 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  40 
 
 
224 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  35.55 
 
 
236 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  38.35 
 
 
236 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  38.28 
 
 
226 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  38.28 
 
 
226 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  40 
 
 
224 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  40 
 
 
224 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  40 
 
 
224 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  40 
 
 
224 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  40 
 
 
224 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  40 
 
 
224 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  40 
 
 
224 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>