81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2943 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  95.51 
 
 		 1623 bp  1774    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2943    100 
 
 		 2890 bp  5729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2940  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 582 bp  1154    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1662    99.76 
 
 		 2712 bp  2484    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  95.69 
 
 		 1623 bp  1790    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  93.49 
 
 		 1623 bp  1600    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  95.6 
 
 		 1623 bp  1782    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  97.98 
 
 		 1623 bp  1988    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  95.69 
 
 		 1623 bp  1790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  95.42 
 
 		 1593 bp  1766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  95.69 
 
 		 1623 bp  1790    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  81.17 
 
 		 1623 bp  478  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  81.33 
 
 		 1623 bp  468  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  80.79 
 
 		 1620 bp  442  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  80.67 
 
 		 1623 bp  438  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  80.81 
 
 		 1623 bp  428  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  79.84 
 
 		 1620 bp  375  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  79.32 
 
 		 1638 bp  220  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  81.32 
 
 		 1602 bp  182  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0557  hypothetical protein  100 
 
 		 117 bp  178  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.493785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  83.47 
 
 		 1605 bp  167  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  78.71 
 
 		 1638 bp  119  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  78.71 
 
 		 1602 bp  119  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  78.71 
 
 		 1602 bp  119  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5044  hypothetical protein  97.01 
 
 		 120 bp  117  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  79.14 
 
 		 1653 bp  107  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  80.24 
 
 		 1608 bp  103  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  100 
 
 		 597 bp  101  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    100 
 
 		 836 bp  101  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    100 
 
 		 597 bp  101  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2038  ggdef domain protein  100 
 
 		 597 bp  99.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2106    100 
 
 		 516 bp  99.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  79.5 
 
 		 1602 bp  99.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  78.34 
 
 		 1620 bp  99.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3956  D-xylose transporter subunit XylF  100 
 
 		 1008 bp  97.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  91.67 
 
 		 1692 bp  95.6  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2034    100 
 
 		 1116 bp  93.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  89.61 
 
 		 1602 bp  89.7  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  96 
 
 		 1611 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  84.26 
 
 		 1611 bp  79.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  89.71 
 
 		 1605 bp  79.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  82.93 
 
 		 1614 bp  77.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  80.35 
 
 		 1680 bp  73.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0614  L-aspartate oxidase  80.11 
 
 		 1650 bp  71.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  87.32 
 
 		 1611 bp  69.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  87.32 
 
 		 1611 bp  69.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  83.17 
 
 		 1614 bp  65.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  85.19 
 
 		 1611 bp  65.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  89.29 
 
 		 1686 bp  63.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  93.18 
 
 		 1596 bp  63.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  79.26 
 
 		 1614 bp  63.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  82.24 
 
 		 1632 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  78.14 
 
 		 1614 bp  61.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  93.02 
 
 		 1629 bp  61.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  90 
 
 		 1617 bp  60  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  90 
 
 		 1620 bp  60  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  81.15 
 
 		 1614 bp  60  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  85.51 
 
 		 1641 bp  58  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  92.68 
 
 		 1602 bp  58  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  84.42 
 
 		 1635 bp  58  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  87.5 
 
 		 1668 bp  56  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  89.58 
 
 		 1596 bp  56  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  80.3 
 
 		 1614 bp  56  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  80.47 
 
 		 1614 bp  56  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  81.82 
 
 		 1683 bp  54  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  86.44 
 
 		 1617 bp  54  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  88 
 
 		 1617 bp  52  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  86.21 
 
 		 1608 bp  52  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  85.48 
 
 		 1605 bp  52  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  88 
 
 		 1617 bp  52  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  92.11 
 
 		 1617 bp  52  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  81.63 
 
 		 1629 bp  52  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  80.33 
 
 		 1614 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  87.04 
 
 		 1614 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  87.04 
 
 		 1614 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  96.55 
 
 		 1521 bp  50.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  93.94 
 
 		 1617 bp  50.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  82.02 
 
 		 1617 bp  50.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  86.79 
 
 		 1626 bp  50.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  96.55 
 
 		 1587 bp  50.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  84.06 
 
 		 1686 bp  50.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>