195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2044 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  99.49 
 
 		 393 aa  762    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  99.49 
 
 		 393 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  99.24 
 
 		 393 aa  760    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  98.98 
 
 		 393 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  100 
 
 		 398 aa  777    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  99.49 
 
 		 393 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  99.49 
 
 		 393 aa  762    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  99.49 
 
 		 393 aa  762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  98.47 
 
 		 393 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  78.83 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  81.22 
 
 		 394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  81.22 
 
 		 394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  81.22 
 
 		 394 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  80.96 
 
 		 394 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  80.71 
 
 		 394 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  52.88 
 
 		 403 aa  359  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  48.47 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 416 aa  308  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  39.57 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  39.78 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  39.25 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  39.25 
 
 		 426 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  39.3 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  41.02 
 
 		 424 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 430 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  38.48 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  36.54 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  35.5 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  36.1 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  41.02 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  37.18 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  36.72 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  37.24 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  37.23 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.72 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  37.2 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  35.86 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  31.65 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 421 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 496 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  35.14 
 
 		 397 aa  166  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  28.53 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  34.54 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  28.95 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.42 
 
 		 451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  29.79 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  33.5 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>