60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3425 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  803    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  49.74 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  46.48 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  47.37 
 
 		 386 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  46.35 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  46.35 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  46.58 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  45.26 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  45.53 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  46.32 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  46.05 
 
 		 420 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  44.74 
 
 		 386 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  43.8 
 
 		 385 aa  322  9.000000000000001e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  38.01 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  34.37 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  30.08 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.45 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.31 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  28.91 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.44 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  27.06 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.05 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.39 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  27.7 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.48 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  28.3 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.18 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  26.49 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.41 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.55 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  26.52 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  26.89 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.41 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  33.5 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.44 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  26.09 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  22.58 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  21.84 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  28.3 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  23.38 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  22.86 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  21.16 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.27 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 		 259 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  26.11 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  27.6 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  21.79 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  23.47 
 
 		 498 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  31.82 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  22.32 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  25.83 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  25.34 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  28.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  25.63 
 
 		 255 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.83 
 
 		 712 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>