More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1638 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  100 
 
 
243 aa  494  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  67.97 
 
 
232 aa  330  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  69.26 
 
 
232 aa  329  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  67.67 
 
 
233 aa  325  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  65.8 
 
 
232 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 
233 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  66.23 
 
 
232 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  66.23 
 
 
232 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 
234 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  66.67 
 
 
231 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  65.37 
 
 
232 aa  317  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  64.22 
 
 
233 aa  316  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  65.8 
 
 
232 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  64.07 
 
 
232 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  65.37 
 
 
232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  65.8 
 
 
232 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  64.07 
 
 
232 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  69.57 
 
 
232 aa  311  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  63.2 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  64.07 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  65.37 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  62.87 
 
 
238 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  61.9 
 
 
232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  57.83 
 
 
236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  58.62 
 
 
235 aa  265  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  54.51 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  52.21 
 
 
232 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  49.35 
 
 
237 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  42.22 
 
 
236 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  43.24 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  49.73 
 
 
232 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  49.19 
 
 
232 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  48.11 
 
 
232 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  41.45 
 
 
236 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  41.45 
 
 
236 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  48.65 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  48.11 
 
 
232 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  48.11 
 
 
232 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  48.11 
 
 
232 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  48.11 
 
 
232 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  47.57 
 
 
232 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  48.11 
 
 
232 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  39.68 
 
 
253 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  41.1 
 
 
235 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  41.81 
 
 
232 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  43.91 
 
 
236 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  41.2 
 
 
235 aa  184  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  43.48 
 
 
236 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  44.4 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  41.38 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  39.01 
 
 
239 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  44.78 
 
 
235 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  44.26 
 
 
236 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 
356 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  44.4 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  42.74 
 
 
234 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  43.1 
 
 
233 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  43.97 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  41.13 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  44.02 
 
 
234 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  40.81 
 
 
238 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  44.07 
 
 
234 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  42.42 
 
 
231 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  40.43 
 
 
241 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  41.92 
 
 
242 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  40.43 
 
 
241 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  42.61 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  42.55 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  43.53 
 
 
232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  41.3 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  41.56 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  39.91 
 
 
233 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
238 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  37.07 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  40 
 
 
232 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  39.48 
 
 
242 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  39.91 
 
 
233 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
231 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  34.89 
 
 
245 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  39.57 
 
 
231 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  39.48 
 
 
233 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  41.56 
 
 
231 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  42.92 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  39.13 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  38.7 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  39.13 
 
 
231 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  36.96 
 
 
233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  38.7 
 
 
231 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  39.48 
 
 
233 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  38.26 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>