158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3823 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  100 
 
 
266 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  89.43 
 
 
265 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  51.6 
 
 
264 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  45.24 
 
 
266 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  44.96 
 
 
267 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  45.71 
 
 
258 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  34.87 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  45.09 
 
 
258 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  45.09 
 
 
258 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  45.09 
 
 
258 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  44.26 
 
 
313 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  40.71 
 
 
249 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  33.87 
 
 
895 aa  122  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.29 
 
 
267 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  38.66 
 
 
294 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.13 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  34.44 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.54 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.54 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  31.75 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  33.86 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.91 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  28.88 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.84 
 
 
811 aa  72.4  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.33 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  28.18 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  33.71 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  35.91 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  30.64 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  27.18 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  31.33 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  26.2 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  26.2 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  29.93 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  37.4 
 
 
764 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.9 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.12 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  22.54 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.21 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.88 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  25 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  24.7 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  28.1 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  22.05 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.39 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.2 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  25.68 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.8 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.69 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.51 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.85 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.39 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.66 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  32.48 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.81 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.17 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  33.08 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  27.04 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  28.99 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  27.85 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  30.86 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0071  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.2 
 
 
217 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00121752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  32.33 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  29.26 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  29.34 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.98 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0838  hypothetical protein  30.84 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.103141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  29.85 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  28.36 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.1 
 
 
656 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.69 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.18 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.88 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.87 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30 
 
 
213 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.63 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  31.34 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.32 
 
 
241 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  33.33 
 
 
277 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.33 
 
 
264 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25.95 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.73 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  25.84 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  24.44 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  25.16 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.56 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  25.73 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  22.47 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.63 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.42 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>