27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0940 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  874    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  67.44 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  37.74 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  35.39 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  37.15 
 
 		 481 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  38.03 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  29.94 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  30.94 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  28.57 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  32.39 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  27.91 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  39.44 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  31.98 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  42.45 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.26 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  29.95 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  29.05 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  31.22 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  32.56 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  35 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  32.48 
 
 		 646 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  31.85 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  24.43 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  30.85 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  27.27 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  27.2 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  30.83 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>