242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2926 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  69.34 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  69 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  69.43 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  69.43 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  69.43 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  69.43 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  70.33 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  70.33 
 
 		 244 aa  267  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  70.33 
 
 		 244 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  69.86 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0903  LrgB family protein  66.81 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000464548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  61.78 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  46.98 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  46.51 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  46.05 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  44 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  43.24 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  44.61 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  44.61 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  42.67 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  42.67 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  42.67 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  42.67 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  42.67 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  42.59 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  41.33 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  42.22 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  44.44 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  44.44 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  44.44 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  44.44 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  44.44 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  45.12 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  44.25 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  42.65 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  37.44 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  43.95 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  42.4 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  45.33 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  45.33 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  41.23 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  44.86 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  42.15 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  45.88 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  43.18 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  35.05 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  42.06 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  42.51 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  36.23 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  37.16 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  36.87 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  37.8 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  39.59 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  36.28 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  37.33 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  39.59 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  39.59 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  35.75 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  35.75 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  33.03 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  35.75 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  32.02 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  31.28 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  31.28 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  31.28 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  34.38 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  30.84 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  36.41 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  36.41 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  34.78 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  34.78 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03101  LrgB-like protein  34.98 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0895138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  31.44 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  30 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  33.78 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  31.53 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  32.71 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  43.27 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  36.41 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  33.68 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  35.59 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  35.59 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  32.56 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.14 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  32.71 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>