176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1562 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1562  ferrichrome-binding protein  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2425  GCN5-related N-acetyltransferase  59.64 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280339  normal  0.117727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3136  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0401409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2161  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0408  acetyltransferase-related protein  30.48 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3088  hypothetical protein  29.93 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002738  acetyltransferase  28.95 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000969588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03244  hypothetical protein  29.2 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  40.45 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  40.79 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  40.79 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.47 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 317 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0946  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0163773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  39.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  39.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  39.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  39.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  32.18 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  38.46 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  39.47 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00230501  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1444  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  31.03 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  29.27 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  28.48 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  24.17 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  29.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  25.24 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  32.93 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  35.9 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  32.95 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0592305  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3250  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.15 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  29.03 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  24.44 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  32.22 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00720  acetyltransferase, GNAT family  36.36 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1178  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>