More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2110 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 		 398 aa  754    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  56.28 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  56.89 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.17 
 
 		 417 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  42.86 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  43.86 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  42.68 
 
 		 419 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.58 
 
 		 422 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  37.78 
 
 		 417 aa  262  8.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  39.8 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  39.8 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  39.2 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  41.65 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  38.69 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  38.97 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  46.84 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  41.75 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  42.37 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  47.09 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.34 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  40.71 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  40.78 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  44.53 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  39.74 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.71 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.79 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  41.41 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  40.24 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  41.08 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.03 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  46.07 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  34.42 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  44.27 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  32.11 
 
 		 396 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  43.11 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  35 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  43.54 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  33.86 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  44.21 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.81 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  51.48 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  48.54 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  44.07 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  39.36 
 
 		 525 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  42.78 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  46.46 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.25 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 459 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.14 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  44.02 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  44.02 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.63 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.63 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  43.63 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  43.63 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  36.32 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  36.12 
 
 		 448 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.05 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  38.66 
 
 		 451 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  30.96 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  33.03 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.93 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  33.65 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.44 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  30.09 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  29.95 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.05 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 552 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 583 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 454 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.6 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.6 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.12 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.66 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.21 
 
 		 529 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.15 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.16 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  36.1 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  31.88 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  36.59 
 
 		 466 aa  109  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 		 525 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>