More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1723 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1723  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  49.63 
 
 
263 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  50 
 
 
270 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  34.3 
 
 
283 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  33.96 
 
 
282 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  33.83 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  36.47 
 
 
285 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  32.47 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  34.98 
 
 
288 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  32.33 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.33 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  32.33 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  32.33 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  32.95 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  31.95 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  33.33 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  35.38 
 
 
319 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  35.74 
 
 
285 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  31.58 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  31.58 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  31.58 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  34.6 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  31.58 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  34.94 
 
 
290 aa  131  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  37.54 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  31.5 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  36.75 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  33.46 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  32.2 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  34.52 
 
 
324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  34.67 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  34.07 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.7 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  34.34 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  35.94 
 
 
478 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  29.96 
 
 
289 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  35.11 
 
 
316 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  34.88 
 
 
318 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  32.73 
 
 
316 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  33.21 
 
 
325 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  31.94 
 
 
280 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  33.21 
 
 
319 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.06 
 
 
318 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  30 
 
 
297 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.67 
 
 
318 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  35.04 
 
 
318 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  32.61 
 
 
315 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  34.67 
 
 
320 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  35.46 
 
 
318 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.06 
 
 
329 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  31.64 
 
 
299 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.31 
 
 
318 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  34.52 
 
 
329 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.31 
 
 
354 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.31 
 
 
354 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.52 
 
 
316 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  32.32 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  32.97 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  33.81 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  32.97 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  32.97 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  36.33 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  30.97 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  36.33 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  32.25 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  31.77 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  34.1 
 
 
295 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  31.29 
 
 
315 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  32.98 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  32.14 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  35.38 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.61 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  34.77 
 
 
321 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  32.98 
 
 
356 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.61 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  32.51 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  32.85 
 
 
324 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  36.46 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  35.77 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  35.77 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  35.04 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.12 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  35.4 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  35.77 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  31.16 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  35.61 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  35.77 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  35.4 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  31.16 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  31.16 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  32.13 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  31.16 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  31.52 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  32 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  33.33 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  31.51 
 
 
365 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  31.51 
 
 
365 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  31.65 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  30.89 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>