More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0742 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  100 
 
 		 378 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  62.3 
 
 		 382 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  62.3 
 
 		 382 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  61.52 
 
 		 382 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  61.26 
 
 		 382 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 382 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  61.52 
 
 		 382 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  61.78 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  59.95 
 
 		 382 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  61.52 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  62.04 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  59.69 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  59.16 
 
 		 382 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  61.52 
 
 		 382 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  60.73 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.85 
 
 		 384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.33 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  56.81 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  58.64 
 
 		 382 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  56.66 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  59.16 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.12 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  58.99 
 
 		 381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  56.28 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  59.42 
 
 		 382 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  53.93 
 
 		 381 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  51.83 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.09 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  51.57 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  51.57 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  52.62 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  52.62 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  51.57 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  51.83 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  52.09 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  51.57 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.31 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  51.57 
 
 		 382 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  53.66 
 
 		 381 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  51.83 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  50 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3772  galactonate dehydratase  51.05 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02060  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  53.28 
 
 		 438 aa  401  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.65 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.45 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  52.36 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.26 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.89 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4035  galactonate dehydratase  43.23 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0120  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.38 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102708  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.6 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.93 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.83 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.76 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.95 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.66 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.5 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.33 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.92 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.64 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  36.36 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3665  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.08 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  33.51 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0954  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  32.31 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000745155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4867  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.08 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.823236  normal  0.123267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.85 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.17 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4412  galactonate dehydratase  35.29 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.737612  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.68 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.89 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.06 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.31 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.06 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.42 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.56 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.77 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.57 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>