More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0663 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  100 
 
 
469 aa  964    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  64.4 
 
 
464 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  58.68 
 
 
453 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  56.75 
 
 
460 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  56.01 
 
 
459 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  55.56 
 
 
459 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  55.76 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  40.77 
 
 
448 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  42.12 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  41.72 
 
 
451 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  40.37 
 
 
480 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  40.23 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  38.88 
 
 
493 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  40.22 
 
 
493 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  38.24 
 
 
480 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  36.77 
 
 
497 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  38.24 
 
 
480 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  36.77 
 
 
497 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  38.24 
 
 
480 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  35.73 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  36.11 
 
 
485 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  36.11 
 
 
485 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  36.11 
 
 
485 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  37.67 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  32.95 
 
 
470 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  33.49 
 
 
469 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  31.51 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  31.38 
 
 
475 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  27.38 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  24.66 
 
 
448 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.78 
 
 
445 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  29.4 
 
 
459 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.32 
 
 
479 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  31.19 
 
 
328 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.67 
 
 
463 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  28.54 
 
 
551 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.96 
 
 
447 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  27.34 
 
 
484 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.68 
 
 
432 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.64 
 
 
452 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.81 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.87 
 
 
439 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.99 
 
 
1365 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  23.76 
 
 
459 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.86 
 
 
446 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  30.95 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  24.6 
 
 
447 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.7 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.04 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.17 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  26.79 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.71 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  24.75 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.24 
 
 
460 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  26.78 
 
 
463 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.97 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  25.54 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  25.54 
 
 
451 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26.08 
 
 
470 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  25.54 
 
 
451 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.34 
 
 
1373 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.48 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.34 
 
 
1380 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  38.17 
 
 
252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  25.06 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  25.17 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  25.87 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.11 
 
 
1373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  28.18 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  27.3 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  36.26 
 
 
474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  36.26 
 
 
474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  36.26 
 
 
453 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  24.59 
 
 
453 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  27.98 
 
 
445 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  25.21 
 
 
445 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.6 
 
 
473 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  25.18 
 
 
455 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  26.87 
 
 
481 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.65 
 
 
454 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  23.71 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  28.8 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  27.76 
 
 
452 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  25.5 
 
 
451 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10479  cytochrome P450, putative (Eurofung)  24.6 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.697152  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  32.47 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  28.47 
 
 
457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  33.93 
 
 
452 aa  120  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  23.24 
 
 
471 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.79 
 
 
453 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  25.56 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.54 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  26.48 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  26.28 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  27.87 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>